Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFNA1P20827 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFNA1P20827 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms