Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB3BP20337 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms