Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF3P18847 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF3P18847 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF3P18847 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF3P18847 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF3P18847 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms