Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPI1P17947 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPI1P17947 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms