Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAV1P15498 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAV1P15498 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAV1P15498 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms