Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACTN1P12814 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms