Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSTAP01040 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSTAP01040 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSTAP01040 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms