Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CBX7O95931 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX7O95931 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX7O95931 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX7O95931 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX7O95931 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CBX7O95931 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms