Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CALUO43852 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CALUO43852 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALUO43852 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CALUO43852 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALUO43852 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALUO43852 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms