Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HTRA2O43464 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HTRA2O43464 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms