Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC7A4O43246 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC7A4O43246 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms