Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF1O43189 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF1O43189 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms