Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLGNO14967 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLGNO14967 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLGNO14967 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLGNO14967 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms