Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRPO00591 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRPO00591 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRPO00591 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRPO00591 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms