Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GFRA2O00451 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GFRA2O00451 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms