Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DFFAO00273 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DFFAO00273 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms