Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms