Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SRRM5B3KS81 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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