Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HMGB1P1B2RPK0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms