Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPBD1B2RD01 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms