Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMCC3Q9ULS5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMCC3Q9ULS5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms