Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF10DQ9UBN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF10DQ9UBN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10DQ9UBN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms