Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms