Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXX6

NSMCE4A, Non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE4AQ9NXX6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE4AQ9NXX6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NSMCE4AQ9NXX6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NSMCE4AQ9NXX6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms