Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTNNBIP1Q9NSA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CTNNBIP1Q9NSA3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms