Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
A4GALTQ9NPC4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A4GALTQ9NPC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A4GALTQ9NPC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A4GALTQ9NPC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms