Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MIXL1Q9H2W2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MIXL1Q9H2W2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MIXL1Q9H2W2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1117.5 ms