Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLIRPQ9GZT3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLIRPQ9GZT3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLIRPQ9GZT3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLIRPQ9GZT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms