Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1QTNF3Q9BXJ4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
C1QTNF3Q9BXJ4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms