Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM4Q9BWF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM4Q9BWF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM4Q9BWF3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM4Q9BWF3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms