Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EIF3CQ99613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF3CQ99613 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF3CQ99613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF3CQ99613 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms