Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TSPAN17Q96FV3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TSPAN17Q96FV3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN17Q96FV3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN17Q96FV3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms