Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ROPN1LQ96C74 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ROPN1LQ96C74 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ROPN1LQ96C74 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms