Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCG3Q8WXD2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCG3Q8WXD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCG3Q8WXD2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms