Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STAG3L4Q8TBR4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STAG3L4Q8TBR4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
STAG3L4Q8TBR4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
STAG3L4Q8TBR4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms