Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOXF1Q8NHV9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOXF1Q8NHV9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOXF1Q8NHV9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms