Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC11Q7Z392 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC11Q7Z392 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAPPC11Q7Z392 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms