Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMD7

Dsg4, Desmoglein-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg4Q7TMD7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg4Q7TMD7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dsg4Q7TMD7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dsg4Q7TMD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dsg4Q7TMD7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms