Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SUSD1Q6UWL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SUSD1Q6UWL2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SUSD1Q6UWL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SUSD1Q6UWL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms