Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PEX6Q13608 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PEX6Q13608 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX6Q13608 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX6Q13608 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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