Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.32□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 NAF1YNL124W 1479 nt5.32□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 DML1YMR211W 1428 nt5.31□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YKR032WYKR032W 315 nt5.31□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 XBP1YIL101C 1944 nt5.31□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 SES1YDR023W 1389 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 HGH1YGR187C 1185 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YJR107WYJR107W 987 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 DPH5YLR172C 903 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 COX5AYNL052W 462 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 ERG10YPL028W 1197 nt5.3□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 HIS7YBR248C 1659 nt5.29□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 COX9YDL067C 180 nt5.29□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 YDL177CYDL177C 513 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 PTC7YHR076W 1032 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 FUS3YBL016W 1062 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 GET4YOR164C 939 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 MIP1YOR330C 3765 nt5.28□□□□□ -1.56
UPS3Q04006 DOC1YGL240W 753 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PSR2YLR019W 1194 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YBL070CYBL070C 321 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 ATP23YNR020C 813 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YBR124WYBR124W 360 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 SCT1YBL011W 2280 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PLB2YMR006C 2121 nt5.27□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 HSP104YLL026W 2727 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PYK2YOR347C 1521 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 IVY1YDR229W 1362 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 MRC1YCL061C 3291 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PFK2YMR205C 2880 nt5.26□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YDR415CYDR415C 1125 nt5.25□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 TRS31YDR472W 852 nt5.25□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 RIB1YBL033C 1038 nt5.25□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 MRPS12YNR036C 462 nt5.25□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 URH1YDR400W 1023 nt5.24□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 SOD2YHR008C 702 nt5.24□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YSC83YHR017W 1158 nt5.24□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 ATG36YJL185C 882 nt5.24□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YLR358CYLR358C 564 nt5.24□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 YOL036WYOL036W 2286 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 CRZ1YNL027W 2037 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 GPI11YDR302W 660 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 SPG5YMR191W 1122 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 TOS6YNL300W 309 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 NTG2YOL043C 1143 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 RPS28AYOR167C 204 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 AMA1YGR225W 1782 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 TEL2YGR099W 2067 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PTK2YJR059W 2457 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 HAL5YJL165C 2568 nt5.23□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 SPG1YGR236C 288 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 REC107YJR021C 945 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 RHO4YKR055W 876 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 HTZ1YOL012C 405 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 MRP51YPL118W 1035 nt5.22□□□□□ -1.57
UPS3Q04006 PPM2YOL141W 2088 nt5.21□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YNR005CYNR005C 405 nt5.21□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 TMA46YOR091W 1038 nt5.21□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 VPS70YJR126C 2436 nt5.21□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 CLB2YPR119W 1476 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 GPB2YAL056W 2643 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YFL042CYFL042C 2025 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YPT1YFL038C 621 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 MGM101YJR144W 810 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YNL092WYNL092W 1203 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 IRC11YOR013W 471 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 SUB2YDL084W 1341 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 PMT3YOR321W 2262 nt5.2□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 VPS5YOR069W 2028 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 PCS60YBR222C 1632 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 MCM6YGL201C 3054 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 CBR1YIL043C 855 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 RPL31BYLR406C 342 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 MRPL19YNL185C 477 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 MOD5YOR274W 1287 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YPR130CYPR130C 408 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 YHR020WYHR020W 2067 nt5.19□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 CIA1YDR267C 993 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 SUF16tG(GCC)C 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 SUF20tG(GCC)F1 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.18□□□□□ -1.58
UPS3Q04006 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms