Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTA2P62736 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTA2P62736 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTA2P62736 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms