Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GEMIN4P57678 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GEMIN4P57678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEMIN4P57678 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEMIN4P57678 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEMIN4P57678 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms