Protein–RNA interactions for Protein: P53314

CPD1, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1P53314 GET4YOR164C 939 nt5.54□□□□□ -1.52
CPD1P53314 HST2YPL015C 1074 nt5.54□□□□□ -1.52
CPD1P53314 PAC2YER007W 1557 nt5.54□□□□□ -1.52
CPD1P53314 MBF1YOR298C-A 456 nt5.53□□□□□ -1.52
CPD1P53314 MSN2YMR037C 2115 nt5.53□□□□□ -1.52
CPD1P53314 QCR6YFR033C 444 nt5.52□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YOX1YML027W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
CPD1P53314 PLB2YMR006C 2121 nt5.52□□□□□ -1.53
CPD1P53314 PEX31YGR004W 1389 nt5.52□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YPL247CYPL247C 1572 nt5.51□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YTH1YPR107C 627 nt5.51□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YLL058WYLL058W 1728 nt5.51□□□□□ -1.53
CPD1P53314 OPT1YJL212C 2400 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 GUF1YLR289W 1938 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 JIP4YDR475C 2631 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 PHO3YBR092C 1404 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 PAP2YOL115W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 HTZ1YOL012C 405 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YPR130CYPR130C 408 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 snR30snR30 606 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 ADH5YBR145W 1056 nt5.5□□□□□ -1.53
CPD1P53314 IME2YJL106W 1938 nt5.49□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YJL144WYJL144W 315 nt5.49□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YCL049CYCL049C 939 nt5.49□□□□□ -1.53
CPD1P53314 BRN1YBL097W 2265 nt5.49□□□□□ -1.53
CPD1P53314 HXT15YDL245C 1704 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 HXT16YJR158W 1704 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 NTE1YML059C 5040 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 APE4YHR113W 1473 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 CYS3YAL012W 1185 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 YJR107WYJR107W 987 nt5.48□□□□□ -1.53
CPD1P53314 CIA1YDR267C 993 nt5.47□□□□□ -1.53
CPD1P53314 URH1YDR400W 1023 nt5.47□□□□□ -1.53
CPD1P53314 GCN3YKR026C 918 nt5.47□□□□□ -1.53
CPD1P53314 AIM33YML087C 939 nt5.47□□□□□ -1.53
CPD1P53314 CUE4YML101C 354 nt5.47□□□□□ -1.53
CPD1P53314 FCY22YER060W-A 1593 nt5.46□□□□□ -1.53
CPD1P53314 VMA2YBR127C 1554 nt5.46□□□□□ -1.53
CPD1P53314 IRS4YKR019C 1848 nt5.46□□□□□ -1.53
CPD1P53314 PDA1YER178W 1263 nt5.46□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YLR162WYLR162W 357 nt5.46□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YNR005CYNR005C 405 nt5.46□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YDL023CYDL023C 321 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 TRS31YDR472W 852 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 AIM46YHR199C 933 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 TOS6YNL300W 309 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 NTG2YOL043C 1143 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YPR204WYPR204W 3099 nt5.45□□□□□ -1.54
CPD1P53314 MIP1YOR330C 3765 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 CBR1YIL043C 855 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 TIF2YJL138C 1188 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 TIF1YKR059W 1188 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 PUS5YLR165C 765 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 SML1YML058W 315 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 ARG81YML099C 2643 nt5.44□□□□□ -1.54
CPD1P53314 HXT17YNR072W 1695 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 VBA5YKR105C 1749 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 KNS1YLL019C 2214 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 HIS1YER055C 894 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 AAD14YNL331C 1131 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 TFB4YPR056W 1017 nt5.43□□□□□ -1.54
CPD1P53314 NMT1YLR195C 1368 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 MSS1YMR023C 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YDL177CYDL177C 513 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YDR401WYDR401W 564 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YDR415CYDR415C 1125 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YUR1YJL139C 1287 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 FIT2YOR382W 462 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YJL163CYJL163C 1668 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 RSC2YLR357W 2670 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 AVT4YNL101W 2142 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 SES1YDR023W 1389 nt5.42□□□□□ -1.54
CPD1P53314 NOG2YNR053C 1461 nt5.41□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.41□□□□□ -1.54
CPD1P53314 ZIM17YNL310C 525 nt5.41□□□□□ -1.54
CPD1P53314 IRC11YOR013W 471 nt5.41□□□□□ -1.54
CPD1P53314 MCP1YOR228C 909 nt5.41□□□□□ -1.54
CPD1P53314 PTC7YHR076W 1032 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 URA1YKL216W 945 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YKR032WYKR032W 315 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 SPG5YMR191W 1122 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 COX5AYNL052W 462 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 DFR1YOR236W 636 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 ERG10YPL028W 1197 nt5.4□□□□□ -1.54
CPD1P53314 YPT1YFL038C 621 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 FHN1YGR131W 525 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 TPK1YJL164C 1194 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 RPL31BYLR406C 342 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 COS10YNR075W 1125 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 ISC1YER019W 1434 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 COX15YER141W 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
CPD1P53314 HEM1YDR232W 1647 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 HIS7YBR248C 1659 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 REC107YJR021C 945 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 YOL046CYOL046C 675 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 LGE1YPL055C 999 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 YPR076WYPR076W 375 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 YMR027WYMR027W 1413 nt5.38□□□□□ -1.55
CPD1P53314 PMT3YOR321W 2262 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.6 ms