Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ETV1P50549 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV1P50549 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV1P50549 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ETV1P50549 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV1P50549 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV1P50549 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ETV1P50549 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ETV1P50549 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ETV1P50549 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ETV1P50549 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ETV1P50549 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ETV1P50549 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ETV1P50549 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ETV1P50549 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ETV1P50549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV1P50549 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV1P50549 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV1P50549 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV1P50549 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ETV1P50549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETV1P50549 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETV1P50549 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETV1P50549 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETV1P50549 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETV1P50549 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETV1P50549 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETV1P50549 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETV1P50549 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms