Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAGEA3P43357 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MAGEA3P43357 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MAGEA3P43357 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MAGEA3P43357 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms