Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSPA4P34932 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
HSPA4P34932 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSPA4P34932 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA4P34932 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms