Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ECHS1P30084 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECHS1P30084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECHS1P30084 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms