Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 FBXO11-209ENST00000492225 2216 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC068631.2-201ENST00000418776 501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.476e-13■■■■■ 46.6
DDX6P26196 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-217ENST00000534805 2043 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR1-218ENST00000515743 4482 ntTSL 511.98□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.514e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-210ENST00000556064 462 ntTSL 411.89□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 311.86□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AC090004.1-202ENST00000601399 787 ntTSL 511.85□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 QTRT1-211ENST00000592376 500 ntTSL 311.85□□□□□ -0.515e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CD164-204ENST00000413644 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-203ENST00000368963 1045 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.525e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTN1-223ENST00000495643 673 ntTSL 311.68□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-211ENST00000518915 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TRPV1-208ENST00000574085 2644 ntTSL 211.62□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)11.62□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-208ENST00000476339 2606 ntTSL 211.54□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 211.52□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-218ENST00000636113 2981 ntTSL 511.5□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-211ENST00000531066 4561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-226ENST00000523461 2435 ntTSL 211.44□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-203ENST00000395023 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TBC1D17-205ENST00000596243 2831 ntTSL 1 (best)11.32□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.66e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 POMT2-206ENST00000554767 5457 ntTSL 211.3□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DCTD-217ENST00000514754 645 ntTSL 311.3□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TMEM260-206ENST00000555046 618 ntTSL 311.23□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 311.21□□□□□ -0.619e-8■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-201ENST00000337940 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF599-201ENST00000329285 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-216ENST00000546483 2098 ntTSL 211.05□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CCDC88C-206ENST00000553437 550 ntTSL 210.94□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA1671-201ENST00000358431 10490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPR107-203ENST00000372410 6991 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-212ENST00000556775 829 ntTSL 510.84□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-206ENST00000554633 533 ntTSL 410.8□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 510.78□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-210ENST00000628103 1958 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPR107-201ENST00000347136 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-204ENST00000554220 586 ntTSL 410.75□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-207ENST00000554760 1113 ntTSL 210.75□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTNNBL1-202ENST00000373469 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C11orf58-208ENST00000527893 813 ntTSL 410.65□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SERPINA5-211ENST00000556730 1463 ntTSL 210.65□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TCF7-223ENST00000522653 5340 ntTSL 210.64□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 WIPF2-201ENST00000323571 7474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.724e-11■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA1671-203ENST00000406486 7864 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ELMSAN1-211ENST00000486739 534 ntTSL 410.37□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ATXN2-212ENST00000492467 887 ntTSL 510.35□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF599-202ENST00000587354 3476 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.776e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 MDH1-216ENST00000544381 1346 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 SETDB1-208ENST00000459773 791 ntTSL 310.14□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 NR1I2-205ENST00000493757 2709 ntTSL 210.13□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 PLEKHA7-219ENST00000637162 3602 ntTSL 510.1□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 KIAA1671-205ENST00000494730 6082 ntTSL 1 (best)10.07□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
DDX6P26196 TAF4-207ENST00000608887 284 ntTSL 410.06□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 46.6
DDX6P26196 ZNF384-216ENST00000545946 500 ntTSL 310.05□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 46.6
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