Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THY1P04216 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THY1P04216 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THY1P04216 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THY1P04216 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THY1P04216 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THY1P04216 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THY1P04216 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THY1P04216 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THY1P04216 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THY1P04216 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THY1P04216 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THY1P04216 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THY1P04216 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THY1P04216 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THY1P04216 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THY1P04216 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THY1P04216 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THY1P04216 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THY1P04216 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THY1P04216 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THY1P04216 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THY1P04216 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THY1P04216 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THY1P04216 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THY1P04216 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THY1P04216 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THY1P04216 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THY1P04216 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THY1P04216 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THY1P04216 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THY1P04216 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THY1P04216 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THY1P04216 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THY1P04216 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THY1P04216 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THY1P04216 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THY1P04216 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
THY1P04216 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
THY1P04216 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THY1P04216 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
THY1P04216 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
THY1P04216 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
THY1P04216 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms